1973年開始創作散文。1979年起連續7次獲臺灣《中國時報》文學獎、散文優秀獎和報導文學優等獎、臺灣報紙副刊專欄金鼎獎等。他的散文文筆流暢清新，表現了醇厚、浪漫的情感，在平易中有著感人的力量。作品有散文集《蓮花開落》《冷月鐘笛》《溫一壺月光下酒》《鴛鴦香爐》《金色印象》《白雪少年》《桃花心木》（選人教版六年級下冊第3課）《在夢的遠方》《在云上》《心田上的百合花》《菠蘿蜜》《用歲月在蓮上寫詩》等。其《和時間賽跑》被選為人民教育出版社課標版小學語文三年級下冊第四單元第13課的一篇課文，也是北師大版四年級下期第十一單元第2課，《百合花開》還選入冀教版小學六年級下冊第12課。并且他的散文集一年中重印超過20次。《桃花心木》被選入人教版小學語文六年級下冊第3課。

林清玄在大陸出版了新書《在云上》和前不久出版的《清音五弦》等，飽含著他對佛教，人生的感悟，非常值得去品味！

林清玄最新作品《心的菩提》《情的菩提》、《馬尾》、《林寺》

2012年，菩提十書重新出版；

2012最新作品《菩提十書》精華三部曲：《境明，千里皆明》《心美，一切皆美》《情深，萬象皆深》

2014最新作品林清玄禪意散文精選（全四冊）：《不爭，是一種慈悲》《不辯，是一種智慧》《不聞，是一種清凈》《不看，是一種自在》。